探索生命《生物學》93
1.
基因活化分為二個步驟:將某一段緊密纏繞的核甘酸(DNA)鬆開,將鬆開的核甘酸線圈的特定基因(群)活化。緊密纏繞的染色質鬆開以後,RNA聚合酶才能夠咬住DNA進行轉錄。
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2.
真核細胞大多仰賴正向調控轉錄:在欠缺轉錄因子蛋白質協助活化的情形下,不會發生基因轉錄;「轉錄因子」幫助「RNA聚合酶」咬住「啟動子」,開始進行轉錄。
3.
除了啟動子區域,染色體上還有其他區域與「調控轉錄因子與DNA的結合」有關。例如,DNA上的增強子區域enhancer regions,增強子與要被活化的基因大約相距幾千個核甘酸。
4.
特定的「調節蛋白」會與DNA上的「增強子」區域結合,當DNA線圈折疊回去,「增強子」上的「調節蛋白質」會接上「啟動子」區域發揮作用。
5.
某些增強子(基因)能夠幫忙下載啟動子(基因)需要的轉錄因子(蛋白質),另外一些增強子能夠幫助RNA聚合酶與啟動子結合,還有一些增強子的功能是抑制RNA聚合酶與啟動子結合。
6.
我們以性荷爾蒙為例,說明增強子和調控蛋白如何操控轉錄。每個個體都有雌雄二種性向的基因,包括控制性器官成長發育的基因,以及控制毛髮分佈、胸部大小和聲音高低與其他第二性徵的基因;
7.
雖然每個個體都有二種性向的基因,但是正常的情況下只會表現出其中一種性徵,這是因為基因性向的表現受到荷爾蒙的影響。「性荷爾蒙」與特定的「接收蛋白」結合,再與DNA的「增強子」區域結合,進一步刺激恰當的目標基因被轉錄。
8.
與啟動子相隔一段距離的增強子,回過頭來指揮啟動子運作的系統(the
action-at-a-distance system)在真核細胞世界十分普遍,有些細菌基因也有一樣的機制。
9.
為什麼真核基因需要這麼多種管道來調控轉錄?看起來答案與真核細胞通常是多細胞生物有關,真核多細胞生物有各種不同的組織與器官,因此需要嚴密調控轉錄
,才能達到細胞特化成各種組織與器官的目的。
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簡而言之,哪些基因應該被活化,不僅與身體立即的代謝需求有關,也與細胞在組織中的位置與發育階段有關。
11.
真核基因與原核基因調控的主要特徵如下:
原核細胞調控RNA聚合酶與DNA的結合方式,通常是採負向調控,用抑制蛋白阻止RNA聚合酶與DNA結合。
真核細胞調控RNA聚合酶與DNA的結合方式,通常是採正向調控,用轉錄因子(TF)協助RNA聚合酶與DNA結合。
原核細胞關於增強子的間接調控方式,只有少數原核細胞用增強子來調控RNA聚合酶與DNA的結合,少數有增強子的原核細胞採用的是負向作用,增強子的功能為抑制RNA聚合酶與DNA的結合。
真核細胞關於增強子的間接調控方式,多數真核細胞用增強子來調控RNA聚合酶與DNA的結合,真核細胞的增強子可能是負向作用,也可能是正向作用,意思是增強子的功能可能是抑制RNA聚合酶與DNA的結合,也可能是協助RNA聚合酶與DNA的結合。
轉錄之後可再調控基因表現Gene Expression Can
Also Be Controlled After Transcription
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我們到目前為止的討論在於,透過控制DNA轉錄,調控mRNA合成的數量。然而細胞用來控制細胞核內資訊轉移的方式不止這一種。
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真核細胞轉錄DNA的立即產物不是有功能的mRNA,而是初級轉錄本,初級轉錄本必須在細胞核內重新裁切編輯過,才變成有功能的mRNA。
14.
用酵素將初級轉錄本,轉換成有功能的mRNA,是細胞調控基因表現的著力點。
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舉例來說,初級轉錄本對產生何種蛋白質十分重要。某些mRNA在轉換過程被裁切掉;另一方面,初級轉錄本的mRNA可用一種以上的方法編輯,以產生不同的蛋白質,看細胞需要的是什麼樣的蛋白質,就量身定做出那種蛋白質的mRNA藍本。
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據統計,細胞核內裁切好的mRNA,大約有一半從未抵達細胞質進行轉譯。細胞應該有一個系統選擇性地阻止細胞核輸出特定的mRNA分子,很可能是當細胞有其需要的時候,就釋放特定的化學訊號,細胞核接收到化學訊號後,就回應做出阻止mRNA輸出的行為。
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即使mRNA抵達細胞質,它也未必能被轉譯,因為細胞釋放的抑制物質能夠阻止RNA與核醣體結合,也能阻止RNA的轉譯。
18.
最後,細胞也可以用控制速率的方式調控mRNA,因為在某些速率會使得mRNA會斷裂。某些種類的mRNA生命期很長,然而另一些mRNA則只有存活短短幾分鐘或幾小時。
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協助轉錄的酵素的活性經常也操控在活化因子activators與抑制因子inhibitors上。許多結構蛋白彼此的組合也受到化學訊號的調控,例如膠原蛋白就是如此。
20.
某些基因表現,在轉錄到轉譯之間的過程,經歷許多調控步驟。這些調控系統一旦失控很可能導致災難性的後果,產生各種疾病,其中最嚴重的疾病就是癌症。
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